Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms