Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CBX7O95931 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CBX7O95931 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CBX7O95931 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms