Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKAP2O75563 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms