Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC45O75419 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC45O75419 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC45O75419 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC45O75419 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC45O75419 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC45O75419 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC45O75419 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC45O75419 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC45O75419 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC45O75419 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC45O75419 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC45O75419 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC45O75419 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC45O75419 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC45O75419 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC45O75419 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC45O75419 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC45O75419 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC45O75419 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC45O75419 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC45O75419 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC45O75419 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC45O75419 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC45O75419 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC45O75419 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC45O75419 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC45O75419 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC45O75419 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC45O75419 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC45O75419 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms