Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP2O75323 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms