Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms