Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTNSO60931 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNSO60931 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms