Protein–RNA interactions for Protein: O60840

CACNA1F, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, humanhuman

Predictions only

Length 1,977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1FO60840 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1FO60840 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms