Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSPNO60542 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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