Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPAG9O60271 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
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