Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMARCA5O60264 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMARCA5O60264 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms