Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VEGFDO43915 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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VEGFDO43915 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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VEGFDO43915 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VEGFDO43915 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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