Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTATSF1O43719 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms