Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms