Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms