Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAPO00193 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAPO00193 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAPO00193 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAPO00193 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAPO00193 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAPO00193 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAPO00193 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAPO00193 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAPO00193 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAPO00193 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms