Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCRIP1C9JLW8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms