Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRDCB7Z8K6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms