Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC169A6NNP5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms