Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms