Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SDR42E2A6NKP2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDR42E2A6NKP2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms