Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MEIS3P1A6NDR6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms