Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF804BA4D1E1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF804BA4D1E1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms