Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC78A2IDD5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms