Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRGMA1A4Y4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRGMA1A4Y4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms