Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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