Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAV27A0A087WT01 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms