Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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