Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGEF1Q9Y6D6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms