Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms