Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NRXN3Q9Y4C0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NRXN3Q9Y4C0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms