Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF330Q9Y3S2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms