Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SH3BP1Q9Y3L3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP1Q9Y3L3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP1Q9Y3L3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1Q9Y3L3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP1Q9Y3L3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SH3BP1Q9Y3L3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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