Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMED5Q9Y3A6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms