Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SBNO2Q9Y2G9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SBNO2Q9Y2G9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms