Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POMPQ9Y244 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms