Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SATB2Q9UPW6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SATB2Q9UPW6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SATB2Q9UPW6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms