Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PNMA8BQ9ULN7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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