Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms