Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBE1Q9UJT0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms