Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAX2Q9UIW0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAX2Q9UIW0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAX2Q9UIW0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAX2Q9UIW0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAX2Q9UIW0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAX2Q9UIW0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAX2Q9UIW0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAX2Q9UIW0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAX2Q9UIW0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VAX2Q9UIW0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VAX2Q9UIW0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms