Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPS51Q9UID3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPS51Q9UID3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms