Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN11AQ9UI33 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN11AQ9UI33 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms