Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPN3Q9UHW5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPN3Q9UHW5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms