Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms