Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLKQ9UBT6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLKQ9UBT6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms