Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPASTQ9UBP0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms