Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC17A6Q9P2U8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms