Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP2BPQ9P2M1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms