Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MBD5Q9P267 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MBD5Q9P267 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms